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Species belonging to selected taxon:

Raphanus sativus, Raphanus sativus var. oleiformis



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002424
species: Raphanus sativus var. oleiformis
miRNA family: MIR2673
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Raphanus sativus var. oleiformis Raphanus sativus Raphanus Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TCTCTTCCTCTTCTTCTTCTT

miRNA*
GGATAATCAAGTGGAGAGAAA

mismatches: 3
bulges: 2

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pre-miRNA
TGCATAAAGGAAGGATAATCAAGTGGAGAGAAAAAGCTAAGCTACACTTACACATACTGTACATGAAGAAGGATTCAAAATTCCATAATTGAGAGACTAA
TCAGTGCACATTAGACTCTAATTACACAAATAAAACCGTATCCGAAACAATACACAGGCTTACATAAAAAACAAAGCAAAAAATGTAGGAGTATTGTTTT
GTCATCTCCGTGGCACATTCAAAGGTTTTATTCTCTCTGGTCTCATCTCCTCTGTTCTTGGAAGGTTTTTATTTAGACAAGAAGGGGTCACCACCATACA
TTGAGTTAAAACTCGCTTTCAGTCTCGTGAACGTACAAACCAGAGGAAAGACAACAAGCAGCTACTCTTTTTATCCCTTATGCTGCTTAGGCTCCTGTTG
CTATTGCTGCTACCGCTCCTCTTTGTGCTCTCGCTACCCCTCGACTCAGGCAATCTATTCCACCACTCTCTATCCTCTGTTTTCAAAGACTCATCAGAGA
TCGAAGGTCTCGGCGAAACCTGAGAATCTTTAACAGAATCCTTCTCCTTTCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCGC


dot-bracket secondary structure
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miRBase no hits

PMRD no hits

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UniProt no hits

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